Nauka
Katedra Fizyki i Biofizyki, Instytut Biologii, SGGW oferuje możliwość wykonania prac doktorskich, magisterskich i licencjackich w zakresie: transportu jonów, elektrofizjologii, biosensorów i nanoprzepływów, biofizyki komórki (głównie produkcja ATP, oddychanie komórkowe).
Prosimy o kontakt: piotr_bednarczyk@sggw.edu.pl
Projekty
Realizowane projekty w Katedrze Fizyki i Biofizyki, Instytutu Biologii, SGGW
Preludium 24
Opracowanie fluorescencyjnego multifunkcjonalnego systemu bioczujnikowego opartego o antysensowne sondy oligonukleotydowe komplementarne do wykrywania onkogenicznych miRNA w celowanej teranostyce raka płuc
NCN (2026-2027)
Kierownik: Mgr inż. Hubert Grel
————————————–
Preludium 24
Rola kanału TMEM16a w mechanizmie obronnym nabłonka jelitowego przeciwko nanoplastikowi
NCN (2026-2027)
Kierownik: Mgr inż. Gabriela Węglińska
————————————–
OPUS 27 – Konsorcjum SGGW (lider), IBD (partner)
Badanie wpływu nanoplastików na uszkodzenia komórkowe: rola mitochondrialnych kanałów potasowych
NCN (2025-2029)
Kierownik: Prof. dr hab. Piotr Bednarczyk
————————————–
OPUS 27 – Konsorcjum IBD (lider), SGGW (partner)
Mitochondrialne kanały potasowe jako sensory i regulatory sygnalizacji redox
NCN (2025-2029)
Kierownik: Prof. dr hab. Piotr Bednarczyk (po stronie partnera)
————————————–
OPUS 25 – Konsorcjum IBD (lider), SGGW (partner)
Zagadka jonów potasowych: rozwikłanie związku między kanałem potasowym a kinazami lipidowymi w funkcjonowaniu nerek.
NCN (2024-2028)
Kierownik: Dr inż. Mirosław Zając (po stronie partnera)
————————————–
Sonata 18
Rola kanałów jonowych TRPA1 i TRPM2 w regulacji fizjologii i metabolizmu
limfocytów T w odpowiedzi na hipoksję.NCN (2024-2027)
Kierownik: Dr Joanna Bujak
————————————–
OPUS 25
Opracowanie dualnych immuno-oligo-bioczujników do monitorowania i kontroli przerzutów raka jelita grubego oraz badanie małocząsteczkowych inhibitorów antyapoptotycznego biomarkera surwiwiny jako potencjalnej terapii przeciwnowotworowej
NCN (2024-2027)
Kierownik: Dr hab. Magdalena Stobiecka, prof. SGGW
————————————–
Perły Nauki I
Nieinwazyjna diagnostyka nowotworowa potencjalnych biomarkerów egzosomalnych neoplazji i metastazy
MNiSW (2023-2026)
Kierownik: Mgr inż. Hubert Grel
————————————–
Preludium 19
Modulacja produkcji ATP przy użyciu inhibitorów glikolizy w komórkach rakowych monitorowanej za pomocą nowych fluorescencyjnych systemów bioczujnikowych opartych na aptamerach.
NCN (2020-2022)
Kierownik: Dr Katarzyna Ratajczak
————————————–
OPUS 18 – Konsorcjum SGGW (lider), IBD (partner)
Rola mitochondrialnych kanałów potasowych w uszkodzeniach wywołanych pyłami miejskimi (PM) – poszukiwanie nowej strategii cytoprotekcji.
NCN (2020-2024)
Kierownik: Prof. dr hab. Piotr Bednarczyk
————————————–
Sonata Bis 9
Wpływ leków, białek mitochondrialnych i biomarkerów miRNA chorób neurodegeneracyjnych na dynamikę i konwersję mitochondriów badanych za pomocą nowych wielofunkcyjnych urządzeń mikroprzepływowych.
NCN (2020-2024)
Kierownik: Dr hab. Sławomir Jakieła, prof. SGGW
————————————–
MINIATURA 2
Badanie transportu jonów i wody przez nabłonek oskrzelikowy w gradientach osmotyczntch – badanie patomechanizmu mukowiscydozy. 2018/02/X/NZ4/00304
NCN (2018-2019)
Kierownik: Dr inż. Mirosław Zając
————————————–
OPUS 13
Biosensory oparte o egzosomy – nowe narzędzia w badaniach przesiewowych i diagnostyce raka oraz system do celowego dostarczania leków. 2017/25/B/ST4/01362
NCN (2018-2021)
Kierownik: Dr hab. Magdalena Stobiecka, prof. SGGW
————————————–
OPUS 11 -Konsorcjum IBD, SGGW, UAM
Flawonoidy kardioprotekcyjne: nowe regulatory mitochondrialnych kanałów
potasowych? 2016/21/B/NZ1/02769NCN (2017-2020)
Kierownik: Prof. dr hab. Piotr Bednarczyk
———————————-
Opus 8
Diagnostyka oparta na pomiarach oporu hydrodynamicznego: Opis ruchu kropli w mikrokanałach jako kierunek rozwoju szybkich, tanich i użytecznych testów diagnostycznych. 2014/15/B/ST4/04955
NCN (2015-2018)Kierownik: Dr hab. Sławomir Jakieła, prof. SGGW
Pracownie
W pracowniach naukowych Katedry Fizyki i Biofizyki, Instytut Biologii, SGGW prowadzone są badania: kanałów jonowych metodą patch-clamp oraz czarnych błon lipidowych; transportu jonów metodą komory Ussinga; prowadzone są hodowle komórek in-vitro; badana jest transfekcja komórek oraz oddziaływanie liposomów z komórkami.
W sprawach współpracy prosimy o kontakt: piotr_bednarczyk@sggw.edu.pl
Pracownia fizyki transportu jonów
Opiekun pracowni: Dr inż. Mirosław Zając
W pracowni prowadzone są badania przepływu jonów przez monowarstwy komórek (np. epitelianych).
Aparatura: komora Ussinga, osmometr, waga analityczna, pompy strzykawkowe, wyparka
Pracownia elektrofizjologii
Opiekun pracowni: Dr Beata Dworakowska
W pracowni prowadzone są badania aktywności kanałów jonowych obecnych w błonach komórkowych (np. błonie plazmatycznej, błonach mitochondrialnych)
Aparatura: zestaw do patch-clamp w konfiguracji whole cell oraz single channel, zestaw do patch-clamp w konfiguracji mitoplast, grzany stolik mikroskopowy, wyciągarka do mikropipet, zestaw do czarnych błon lipidowych.
Pracownia biosensorów
Opiekun pracowni: Dr hab. Magdalena Stobiecka, prof. SGGW
W pracowni opracowywane są biosensory oraz systemy do pomiarów z wykorzystaniem mikroprzepływów.
Aparatura: elektrochemiczna waga kwarcowa.
Pracownia fizyki nanoprzepływów
Opiekun pracowni: dr hab. Sławomir Jakieła, prof. SGGW
Wykonywane są pomiary przepływów dwufazowych. Badania dotyczą właściwości reologicznych mikro-, nano-, piko-litrowych kropel.
Aparatura: karty NI, mikroskop optyczny z kontrastem fazowym, kamery liniowe i CMOS, frezarka CNC, stanowisko optyczne do badania interferencji oraz elektroniczne.
Pracownia biofizyki komórki
Opiekun pracowni: Prof. dr hab. Piotr Bednarczyk
W pracowni wykonywane są pomiary produkcji ATP, potencjału na błonie mitochondrialnej oraz szybkości oddychania komórek.
Aparatura: Oxygraph/Oroboros, czytnik płytek, spektrometr.
Pracownia hodowli komórkowych
Opiekun pracowni: Dr Beata Dworakowska
W pracowni prowadzone są hodowle komórek na potrzeby funkcjonowania pozostałych pracowni naukowych Katedry Fizyki.
Aparatura: laminar, inkubator, łaźnia wodna, elektroporator, wirówki, urządzenia do sterylizacji, piec 300 C, zamrażarki -20 C, -80 C, lodówki 4-8 C, system do oczyszczania wody.
Pracownia biofizyki farmaceutycznej
Opiekun pracowni: Dr hab. Katarzyna Wiktorska, prof. SGGW
Pracownia Biofizyki Farmaceutycznej prowadzi interdyscyplinarne badania naukowe na styku fizyki, biologii komórki i farmacji. Celem jednostki jest poszukiwanie nowoczesnych opcji terapeutycznych w walce z chorobami cywilizacyjnymi, ze szczególnym uwzględnieniem schorzeń nowotworowych oraz poszukiwanie możliwości rozwoju rozwiązań dla nowoczesnych leków, w tym cząsteczek o charakterze biologicznym.Główne obszary badawcze:- Charakterystyka związków czynnych: Prowadzone są badania nad nowymi substancjami pochodzenia naturalnego o potencjalnych właściwościach farmakologicznych.
- Mechanizmy molekularne: Analizuje się fizykochemiczne aspekty działania leków i biomolekuł oraz ich interakcje z celami molekularnymi i innymi biocząsteczkami. Szczególna uwaga poświęcana jest roli czynnika Nrf2 w mediowaniu odpowiedzi komórkowej.
- Losy farmaceutyków w komórce: Śledzi się wewnątrzkomórkową drogę leków oraz ich wpływ na funkcjonowanie komórek i tkanek.
- Nowoczesne formulacje: Projektowane są inteligentne systemy dostarczania leków, czułe na parametry fizyczne (pH, temperatura).
W pracy badawczej wykorzystywane są zróżnicowane metody fizyczne i biofizyczne, w tym:- Spektroskopia: UV-Vis oraz techniki fluorescencyjne.
- Badania in vitro:
- Testy cytotoksyczności (wyznaczanie parametrów IC50, SI).
- Analiza interakcji lek-lek (Combination Index).
- Badanie dostępności biologicznej w modelu komórek Caco-2 (wyznaczanie współczynnika Papp zgodnie z klasyfikacją BCS).
- Mikroskopia: Przygotowanie preparatów, Obrazowanie i Analiza obrazów tkanek i pojedynczych komórek (wykorzystując udostępnianą aparaturę w tym mikroskop konfokalny).
- Osmometria: wyznaczanie osmolarności roztworów.