Kierownik: Hanna Bolibok-Brągoszewska
Postdoc: Anna Hawliczek, David Chan-Rodriguez
Studenci i praktykanci: Aleksandra Paradowska, Maksymilian Królik, Brian Wakimwayi Koboyi
W przeszłości:
Studenci: Marianna Droszcz, Adam Kral, Oliwia Kielak, Maria Jóźwiak, Julia Maksymiuk, Shafeeq ur Rehman
Stażyści i praktykanci Erasmus: Yaren Elmas, Hilderlith Awuor Abuya, Ilteris Kutlug Onal, Beyza Nur Telli, Mertcan Gulben, Simran Asawa, Macarena Pozo Morales, Timea Papp, Alexandra Kiss, Usman Khalid Chaudhry, Anna Ringauf, Kathrin Schmittner, Shivaksh Ahluvalia
Naukowcy wizytujący: Fatemeh Shoormij, Saida Sharifova
Zespół polimorfizmu genomów.
Problematyka badawcza zespołu to:
Genetyczne uwarunkowania tolerancji niedoboru fosforu
Identyfikacja i charakterystyka rejonów genomu żyta poddanych presji selekcyjnej
Charakterystyka zróżnicowania genetycznego zasobów genowych żyta przy wykorzystaniu różnych typów markerów DNA (GBS, SSR)
Wykorzystanie wysokoprzepustowego sekwencjonowania amplikonów do identyfikacji funkcjonalnych wariantów wybranych genów w zasobach genowych
Konstrukcja wysokorozdzielczych map genetycznych
Prowadzone projekty badawcze:
Identyfikacja i charakterystyka genów warunkujących tolerancję niedoboru fosforu u żyta (Secale cereale L.) – rośliny o wysokiej tolerancji niedoboru składników pokarmowych, 2021-2025 – NCN OPUS19 nr 2020/37/B/NZ9/00738
Wpływ selekcji na genom rośliny uprawnej – identyfikacja i charakterystyka sekwencji, na które nakierowana była presja selekcyjna w trakcie udomowienia i hodowli żyta (Secale cereale L.), 2015-2021, projekt NCN Sonata Bis 4 DEC-2014/14/E/NZ9/00285
Eksploracja regionów bogatych w geny u gatunku o dużym genomie (Secale cereale L.) z wykorzystaniem markerów DArT, 29.08.2012-28.08.2015, projekt NCN Opus 2 nr 2011/03/B/NZ2/02480
Kompleksowa charakterystyka molekularna zróżnicowania genetycznego uprawnych i dzikich form w rodzaju Secale, 29.11.2010-28.11.2013, projekt własny MNiSW, numer NN310 080139
Publikacje (5 wybranych):
Selective sweeps identification in distinct groups of cultivated rye (Secale cereale L.) germplasm provides potential candidates for crop improvement
Hawliczek A, Borzecka E, Tofil K, Alachiotis N, Bolibok L, Gawroński P, Siekmann D, Hackauf B, Dusinsky R, Svec M, Bolibok-Brągoszewska H. (2023) Biorvix doi: 10.1101/2023.01.22.525081
Deep sampling and pooled amplicon sequencing reveals hidden genic variation in heterogeneous rye accessions
Hawliczek A, Bolibok L, Tofil K, Borzęcka E, Jankowicz-Cieślak J, Gawroński P, Kral A, Till BJ, Bolibok-Brągoszewska H. (2020) BMC Genomics 21:845; doi: 10.1186/s12864-020-07240-3
Effective BAC clone anchoring with genotyping-by-sequencing and Diversity Arrays Technology in a large genome cereal rye.
Borzecka E, Hawliczek-Strulak A, Bolibok L, Gawronski P, Tofi K, Milczarski P, Stojalowski S, Myskow B, Targonska-Karasek M, Gradzielewska A, Smolik M, Kilian A, Bolibok-Bragoszewska H. (2018) Sci Rep 8:8428; doi: 10.1038/s41598-018-26541-
DArT markers effectively target gene space in the rye genome
Gawroński P, Pawełkowicz M, Tofil K, Uszyński G, Sharifova S, Ahluvalia S, Tyrka M, Wędzony M, Kilian A, Bolibok-Brągoszewska H. (2016) Front Plant Sci 7:1600; doi: 10.3389/fpls.2016.01600
Genome-wide characterization of genetic diversity and population structure in Secale
Bolibok-Brągoszewska H, Targońska M, Bolibok L, Kilian A, Rakoczy-Trojanowska M. (2014) BMC Plant Biol 14:184; doi: 10.1186/1471-2229-14-184