Zespół biologii RNA
Kierownik: dr Piotr Gawroński
Magda Tyszkiewicz, Agata Michalak, Paulina Pomarańska, Kinga Gołębiewska, Kamila Wawrzyniak, Krzysztof Świąder, Krzysztof Wardak
Problematyka badawcza zespołu
Chloroplasty są organellami półautonomicznymi, które posiadają swój własny, mocno zredukowany genom i aparat translacyjny typu bakteryjnego (rybosomy typu 70S). Jednak ekspresja genów chloroplastowych cechuje się również unikalnymi właściwościami, do których zaliczyć można złożoną regulację na poziomie inicjacji i elongacji translacji. Naszym głównym celem jest zrozumienie molekularnych mechanizmów regulacji translacji w chloroplastach, które wytwarzają do 50% białek znajdujących się w liściach. Skupiamy się na badaniu wpływu struktury II-rzędowej RNA oraz poziomu tRNA na translację w chloroplastach wykorzystując wysokoprzepustowe metody sekwencjonowania (NGS) i zaawansowane analizy bioinformatyczne.
Struktura przestrzenna fragmentu 5’UTR mRNA psbA
Projekty badawcze
Aktualne
Rola ekspresji i modyfikacji tRNA w procesie translacji w chloroplastach podczas stresu. 2022-2027, NCN, Sonata-bis 11
Zakończone
Regulacja elongacji translacji w chloroplastach przez reaktywne formy tlenu, status redoks i gradient protonowy. 2017 – 2021 NCN, Sonata 12
Publikacje naukowe
2024
2023
…
2022
…
2021
…
2020
Light-dependent translation change of Arabidopsis psbA correlates with RNA structure alterations at the translation initiation region.
Gawroński P, Enroth C, Kindgren P, Marquardt S, Karpiński S, Leister D, Jensen PE, Vinther J, Scharff LB. (2020) bioRxiv 10.1101/2020.06.11.145870Secondary Structure of Chloroplast mRNAs In Vivo and In Vitro.
Gawroński P, Pałac A, Scharff LB. (2020) Plants 9:323
2019
…
2018
Pausing of Chloroplast Ribosomes Is Induced by Multiple Features and Is Linked to the Assembly of Photosynthetic Complexes.
Gawroński P, Jensen PE, Karpiński S, Leister D, Scharff LB (2018) Plant Physiol 176:2557-2569. doi: 10.1104/pp.17.01564.CHLOROPLAST RIBOSOME ASSOCIATED Supports Translation under Stress and Interacts with the Ribosomal 30S Subunit.
Pulido P, Zagari N, Manavski N, Gawronski P, Matthes A, Scharff LB, Meurer J, Leister D. (2018) Plant Physiol 177:1539-1554. doi: 10.1104/pp.18.00602
Informacje o wynikach naboru na stanowisko Post-doc w ramach projektu SONATA BIS11
06.02.2023
Informujemy, że komisja rekrutacyjna postanowiła zaproponować stanowisko samodzielnego biotechnologa (post-doc) w ramach projektu SONATA BIS11 Narodowego Centrum Nauki Pani Sylwii Kacprzak, Polska.
Uzasadnienie: spośród wszystkich kandydatów, Pani Sylwia Kacprzak spełniła wymagania konkursu w najwyższym stopniu.
26.09.2022
Informujemy, że komisja rekrutacyjna postanowiła zaproponować stanowisko biotechnologa (post-doc) w ramach projektu SONATA BIS11 Narodowego Centrum Nauki Panu Muhammad Imran, Pakistan.
Uzasadnienie: spośród kandydatów, Pan Muhammad Imran spełnił wymagania konkursu w najwyższym stopniu.