Zespół biologii RNA
Kierownik: dr hab. Piotr Gawroński
Członkowie: dr Sylwia Kacprzak, mgr Kinga Gołębiewska, Andrzej Rzepko, Magdalena Zabielska, Jakub Figurski
Alumni: Martyna Adach, Bartosz Biernacik, Zofia Czeremużyńska, Paulina Dwojak, Agnieszka Grabiec, Grzegorz Hycnar, Abraham de Jonge, Konrad Łosiński, Katarzyna Maleta, Agata Michalak, Lidia Muszyńska, Maciej Najechalski, Aleksandra Pałac, Rafał Piwnicki, Natalia Warchałowska, Krzysztof Świąder, Magdalena Tyszkiewicz, Krzysztof Wardak, Kamila Wawrzyniak, Patryk Werner, Julia Zaremba.
Problematyka badawcza zespołu
Chloroplasty są półautonomicznymi organellami, które zachowały własny, silnie zredukowany genom oraz aparat translacyjny typu bakteryjnego (rybosomy 70S). Ekspresja genów chloroplastowych wykazuje jednak szereg unikalnych cech, w tym złożoną regulację na poziomie inicjacji i elongacji translacji.
Głównym celem naszego zespołu jest poznanie molekularnych mechanizmów regulujących translację w chloroplastach, które syntetyzują nawet do 50% wszystkich białek obecnych w liściach. W szczególności koncentrujemy się na badaniu tRNA i rRNA chloroplastowych — analizujemy ich poziomy ekspresji, wzory modyfikacji oraz identyfikujemy i charakteryzujemy nowe białka odpowiedzialne za wprowadzanie modyfikacji oraz dojrzewanie rybosomów.
W naszych badaniach wykorzystujemy szeroki wachlarz metod biologii molekularnej, techniki wysokoprzepustowego sekwencjonowania (NGS) oraz zaawansowane analizy bioinformatyczne, prowadzone głównie na organizmie modelowym Arabidopsis thaliana.
Zdjęcie przedstawia reakcję Arabidopsis thaliana na stres wywołany wysokim natężeniem światła. W dolnej części pokazano obraz fluorescencji chlorofilu a.
(Autor: K. Gołębiewska)
Zdjęcie przedstawia reakcję Arabidopsis thaliana na stres wywołany wysokim natężeniem światła. W dolnej części pokazano obraz fluorescencji chlorofilu a.
(Autor: K. Gołębiewska)
Prowadzone projekty badawcze
Aktualne
Rola ekspresji i modyfikacji tRNA w procesie translacji w chloroplastach podczas stresu. 2022-2027, NCN, Sonata-bis 11 (kierownik: Piotr Gawroński)
Rola GTPazy Era1 w biogenezie rybosomów chloroplastowych i translacji. 2025-2027, NCN Preludium-23 (kierownik: Kinga Gołębiewska)
Zakończone
Regulacja elongacji translacji w chloroplastach przez reaktywne formy tlenu, status redoks i gradient protonowy. 2017 – 2021 NCN, Sonata 12 (kierownik: Piotr Gawroński)
Publikacje (5 wybranych)
Gawroński P, Burdiak P, Scharff LB, Mielecki J, Górecka M, Zaborowska M, Leister D, Waszczak C, and Karpiński S. CIA2 and CIA2‐LIKE are required for optimal photosynthesis and stress responses in Arabidopsis thaliana. Plant J. 2021a:105(3):619–638. https://doi.org/10.1111/tpj.15058
Gawroński P, Enroth C, Kindgren P, Marquardt S, Karpiński S, Leister D, Jensen P, Vinther J, and Scharff L. Light-Dependent Translation Change of Arabidopsis psbA Correlates with RNA Structure Alterations at the Translation Initiation Region. Cells. 2021b:10(2):322. https://doi.org/10.3390/cells10020322
Gawroński P, Jensen PE, Karpiński S, Leister D, and Scharff LB. Pausing of Chloroplast Ribosomes Is Induced by Multiple Features and Is Linked to the Assembly of Photosynthetic Complexes. Plant Physiol. 2018:176(3):2557–2569. https://doi.org/10.1104/pp.17.01564
Gawroński P, Pałac A, and Scharff LB. Secondary Structure of Chloroplast mRNAs In Vivo and In Vitro. Plants. 2020:9(3):323. https://doi.org/10.3390/plants9030323
Gołębiewska K, Gregorová P, Sarin LP, and Gawroński P. Deciphering the RNA Modification Landscape in Arabidopsis Chloroplast tRNAs and rRNAs Reveals a Blend of Ancestral and Acquired Characteristics. 2024. https://doi.org/10.1101/2024.06.14.598963
Łuszczyna mutanta Arabidopsis thaliana; białe nasiona wskazują, że mutacja prowadzi do zahamowania rozwoju zarodka.
(Autor: S. Kacprzak)
Analiza lokalizacji subkomórkowej białka połączonego z białkiem żółtej fluorescencji (YFP). Obraz uzyskano przy użyciu mikroskopii konfokalnej.
(Autor: S. Kacprzak)
Informacje o wynikach naboru na stanowisko Post-doc w ramach projektu SONATA BIS11
06.02.2023
Informujemy, że komisja rekrutacyjna postanowiła zaproponować stanowisko samodzielnego biotechnologa (post-doc) w ramach projektu SONATA BIS11 Narodowego Centrum Nauki Pani Sylwii Kacprzak, Polska.
Uzasadnienie: spośród wszystkich kandydatów, Pani Sylwia Kacprzak spełniła wymagania konkursu w najwyższym stopniu.
26.09.2022
Informujemy, że komisja rekrutacyjna postanowiła zaproponować stanowisko biotechnologa (post-doc) w ramach projektu SONATA BIS11 Narodowego Centrum Nauki Panu Muhammad Imran, Pakistan.
Uzasadnienie: spośród kandydatów, Pan Muhammad Imran spełnił wymagania konkursu w najwyższym stopniu.