Zespół biologii RNA
Kierownik: dr Piotr Gawroński
Magda Tyszkiewicz, Agata Michalak, Paulina Pomarańska, Kinga Gołębiewska, Kamila Wawrzyniak, Krzysztof Świąder, Krzysztof Wardak
Problematyka badawcza zespołu
Chloroplasty są organellami półautonomicznymi, które posiadają swój własny, mocno zredukowany genom i aparat translacyjny typu bakteryjnego (rybosomy typu 70S). Jednak ekspresja genów chloroplastowych cechuje się również unikalnymi właściwościami, do których zaliczyć można złożoną regulację na poziomie inicjacji i elongacji translacji. Naszym głównym celem jest zrozumienie molekularnych mechanizmów regulacji translacji w chloroplastach, które wytwarzają do 50% białek znajdujących się w liściach. Skupiamy się na badaniu wpływu struktury II-rzędowej RNA oraz poziomu tRNA na translację w chloroplastach wykorzystując wysokoprzepustowe metody sekwencjonowania (NGS) i zaawansowane analizy bioinformatyczne.
Proces wprowadzania białka do wnętrza sporoplastu monitorowany przez fluorescencję białka Citrine
Prowadzone projekty badawcze:
- Regulacja elongacji translacji w chloroplastach przez reaktywne formy tlenu, status redoks i gradient protonowy. 2017 – 2021 NCN, Sonata 12
Publikacje:
Pausing of Chloroplast Ribosomes Is Induced by Multiple Features and Is Linked to the Assembly of Photosynthetic Complexes.
Gawroński P, Jensen PE, Karpiński S, Leister D, Scharff LB (2018) Plant Physiol 176:2557-2569. doi: 10.1104/pp.17.01564.
CHLOROPLAST RIBOSOME ASSOCIATED Supports Translation under Stress and Interacts with the Ribosomal 30S Subunit.
Pulido P, Zagari N, Manavski N, Gawronski P, Matthes A, Scharff LB, Meurer J, Leister D. (2018) Plant Physiol 177:1539-1554. doi: 10.1104/pp.18.00602
Secondary Structure of Chloroplast mRNAs In Vivo and In Vitro.
Gawroński P, Pałac A, Scharff LB. (2020) Plants 9:323
Light-dependent translation change of Arabidopsis psbA correlates with RNA structure alterations at the translation initiation region.
Gawroński P, Enroth C, Kindgren P, Marquardt S, Karpiński S, Leister D, Jensen PE, Vinther J, Scharff LB. (2020) bioRxiv 10.1101/2020.06.11.145870