SGGW Witryn / Home / Instytut Biologii / Struktura / Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin / Nauka / Zespół Genomiki Roślin i Interakcji Środowiskowych

Zespół Genomiki Roślin i Interakcji Środowiskowych

Kierownik: dr hab. inż. Magdalena Pawełkowicz, prof. SGGW

Zespół: dr inż. Agata Głuchowska, dr inż. Agnieszka Skarzyńska, mgr inż. Maksymilian Pisz, mgr Aparna

Problematyka badawcza

Zespół Genomiki Roślin i Interakcji Środowiskowych prowadzi badania nad molekularnymi mechanizmami rozwoju, odporności i adaptacji roślin do zmieniających się warunków środowiska. Wykorzystujemy narzędzia genomiki, transkryptomiki, epigenomiki i bioinformatyki, aby zrozumieć, jak rośliny reagują na stres, patogeny i zanieczyszczenia, wspierając rozwój zrównoważonego rolnictwa.

 

Zespół Genomiki Roślin i Interakcji Środowiskowych prowadzi badania w zakresie:

  1. Molekularnych podstaw rozwoju roślin i regulacji procesów wzrostu na poziomie genomu i epigenomu.
  2. Interakcji roślin z czynnikami środowiskowymi, w tym patogenami, zanieczyszczeniami i stresem abiotycznym.
  3. Analiz omicznych (genomika, transkryptomika, epigenomika) oraz narzędzi bioinformatycznych w badaniach funkcji genów.
  4. Mechanizmów odporności i adaptacji roślin do zmieniających się warunków środowiska.
  5. Zastosowania wyników badań w rozwoju biotechnologii roślinnej i wspieraniu zrównoważonego rolnictwa.

 

Projekty badawcze

  • KZLw – Analiza mikrobiomu gleby – 2025 – 2026
  • NCN OPUS 2020/37/B/NZ9/00586: Integracja danych multi-omicznych ogórka w celu identyfikacji mechanizmów determinacji płci i ich uwarunkowań klimatycznych.2020 – 2027;
  • European Plant Phenotyping Network: Identification of metabolic parameters related to flower sex expression in cucumber plants. 7th Framework Program UE; 2012 – 2015
  • NCN OPUS 2011/01/B/NZ2/01631: Analiza transkryptomów w rozwiązaniu zagadnienia determinacji płci roślin. 2011 – 2016 r. kierownik projektu
Zdjęcie przedstawia zintegrowane sieci multiomiczne dla kolejnych etapów rozwoju kwiatów męskich ogórka, obejmujących porównania pąków kwiatowych ze stożkiem wzrostu (SI vs Apex) oraz pomiędzy następującymi po sobie stadiami rozwoju pąków kwiatowych: SI (1–2 mm), SII (3–5 mm), SIII (6–8 mm) i SIV (9mm). Sieci integrują geny o zróżnicowanej ekspresji (DEGs), metabolity o zróżnicowanej akumulacji (DAMs), wzbogacone ścieżki metaboliczne oraz odpowiadające im terminy ontologii genów (GO) i ścieżki KEGG. Węzły reprezentują elementy pochodzące z różnych warstw danych omicznych, natomiast połączenia wskazują na ich funkcjonalne zależności i wspólne zaangażowanie w procesy biologiczne związane z rozwojem kwiatów. (Turek, S., et. al. (2025). Multi-omics integration of transcriptome, miRNA, and metabolome uncovers molecular mechanisms of male flower development in cucumber line B10 (Cucumis sativus L.). Scientific reports, 15(1), 45734. https://doi.org/10.1038/s41598-025-28485-6)

Publikacje (5 wybranych)

Pawełkowicz, M., Głuchowska, A., Mirzwa-Mróz, E., Zieniuk, B., Yin, Z., Zamorski, C., & Przybysz, A. (2025). Molecular insights into powdery mildew pathogenesis and resistance in cucurbitaceous crops. Agriculture, 15(16), 1743.

Głuchowska, A., Zieniuk, B., & Pawełkowicz, M. (2025). Unlocking Plant Resilience: Metabolomic Insights into Abiotic Stress Tolerance in Crops. Metabolites, 15(6), 384.

Zhang, B., Zhou, Y., Pawełkowicz, M., Wójcik-Gront, E., Pismanik, M., Wnorowski, Ł., … & Przybysz, A. (2024). A comparative study of foliar particulate matter wash-off from plants under natural and simulated rain conditions. Scientific reports, 14(1), 28409.

Wójcik-Gront, E., Zieniuk, B., & Pawełkowicz, M. (2024). Harnessing AI-powered genomic research for sustainable crop improvement. Agriculture, 14(12), 2299.

Pawełkowicz, M., Zieniuk, B., Staszek, P., & Przybysz, A. (2024). From sequencing to genome editing in Cucurbitaceae: application of modern genomic techniques to Enhance Plant traits. Agriculture, 14(1), 90.

Kontakt: dr hab. Magdalena Pawełkowicz, Prof. SGGW